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RaspberryPiで新型コロナウイルスの解析

807 バイト追加, 2021年9月8日 (水)
具合
=='''具合'''==
COVID-19-01 Rosetta@home 3B+<br />
COVID-19-02 Rosetta@home 3B ※雷マーク<br />
COVID-19-03 Rosetta@home 3B<br />
COVID-19-04 World Community Grid 2B<br />
COVID-19-08 Folding@home 4B ※故障<br />
COVID-19-00 Netdata 2B
<!--
2021.09.04<br />
<pre>
Pi3B+でRosetta@homeを追加設定してみた
$ sudo nano /var/lib/boinc-client/global_prefs.xml
(global_prefs_override.xmlと同じ設定を貼り付け)
$ sudo service boinc-client restart
$ boinccmd --passwd AAAAAAAAA --project https://boinc.bakerlab.org/rosetta/ update
</pre>
-->
=='''環境'''==
メモ<br />
[https://github.com/deepmind/alphafold AlphaFold]<br />[https://itsuka-naritai.com/2020/10/25/autodock-vina%E3%81%A7%E3%83%89%E3%83%83%E3%82%AD%E3%83%B3%E3%82%B0%E8%A8%88%E7%AE%97%E3%82%92%E3%81%99%E3%82%8B/ AutoDock Vinaでドッキング計算をするVina]<br />[https://www.google.com/search?q=%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83%8A+%E6%97%A2%E5%AD%98%E8%96%AC+%E3%82%B9%E3%82%AF%E3%83%AA%E3%83%BC%E3%83%8B%E3%83%B3%E3%82%B0 新型コロナ 既存薬 スクリーニング - Google 検索]
=='''動作環境'''==
必要なメモリ<br />
Folding@home … 512MB~<br />
Rosetta@home … 1000MB程度~<br />
World Community Grid … 250MB程度~<br />
TN-Grid … 70MB程度~<br />
SiDock@home …
 
※ Pi3モデルのログ
2021/**/** **:**:** | Rosetta@home | プロジェクト・サーバからのメッセージ: Rosetta needs 3337.86 MB RAM but only 959.81 MB is available for use.
安定動作は4Gモデルと思う 未確認
多分動くモデル

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